StarLighter一步法染色质开放性建库试剂盒

StarLighter一步法染色质开放性建库试剂盒

染色质开放性是指染色质中     DNA      与组蛋白结合松散、允许调控因子（如转录因子）结合的区域特性，可通过ATAC-seq  检测这些开放区域以研究基因调控机制。传统 ATAC-seq  需提取细胞核，再用 Tn5  转座酶处理。由于提取细胞核的步骤较为繁琐、去除细胞膜的效率不稳定等因素，对实验时间和成功率可能造成影响。

StarLighter One-Step ATAC-seq Kit 通过启衡星生物自主研发的一步法 ATAC 缓冲液，对 PBS 洗涤后的细胞进行简单处理后，即可直接用于 Tn5 酶切的反应，显著简化建库流程。 同时，经过一步法 ATAC 缓冲液处理的细胞，还可以在 4℃稳定保存72 小时，利于临床样本的处理。

试剂盒信息

实验流程


 产品亮点
1. 低细胞起始量，每个样本 50,000 个细胞即可
2. 自研一步法试剂，流程简化，实验重复性好，成功率提高
3. 可同时揭示开放染色质的基因组位置、DNA结合蛋白和转录结合位点的相互作用


产品应用
1. 基因调控、表观遗传异常等研究，识别启动子、超级增强子等调控元件
2. 识别驱动细胞命运、疾病或应答相关的转录因子3. 多组学整合，联合 CUT&Tag、Hi-C 等技术，绘
制多维度调控网络


实测数据

客户文章

1. Nat Cell Biol：曲晓刚团队开发特异性靶向 DNA G-四链体新技术 (DOI: 10.1038/s41556-024-01448-1)

    这项研究联合 CRISPR 技术和 G4 结合蛋白 / 配体开发出了一种可以选择性靶向特定基因组 G4 结构的新策略。文章使用 ATAC-seq  分析了dCas9–nucleolin  系统靶向 G4  后对染色质结构的影响，发现 G4  稳定化导致目标基因启动子区域的染色质开放程度显著降低，抑制了转录因子的结合。同时， RNA-seq     数据显示，这些基因的表达水平随之下调，而全转录组范围内仅少数非靶向基因出现轻微波动，证实了系统的高特异性。两者的联合分析表明，G4    结构可通过改变染色质构象直接影响转录活性。

2. Adv Sci：超级增强子在胰腺导管癌药物治疗中起重要作用

    (DOI: 10.1002/advs.202308637)

    这篇文章通过多组学技术系统研究了超级增强子（SE）在胰腺导管腺癌治疗中的作用。研究团队对激活的胰腺星状细胞（a-PSCs）进行了 H3K27ac ChIP-seq 和 ATAC-seq 测序，结合 ROSE 算法鉴定出与促纤维化基因（如 FAP-α、IL6）相关的 SE 区域，并利用 CRISPR/ Cas9 敲除增强子位点验证其调控功能。同时，通过 RNA-seq 分析 JQ1（BRD4 抑制剂）处理后基因表达的变化，发现 SE 失活可显著下调促纤维化通路并重塑肿瘤微环境。研究揭示了 SE 促进与 a-PSCs 激活相关的各种基因的表达。